港澳通行证丢了可以申请补办。补办港澳通行证流程：
1、先到出入境事务厅办理《遗失证件及报到通知书》。
2、在《遗失证件及报到通知书》的有效期内，提交符合《出入境证件相片照相指引》标准的申请人照片。
3、交验申请人居民身份证原件，申请人未满16周岁，也可交验居民户口簿；军人应交验军人身份证明。上述身份证件须留存复印件或者电子扫描图片。
4、按要求用银行卡付费，领取办证回执。
5、在回执上所示领证日期或之后凭本人身份证和回执领取。户籍地15个工作日，非户籍地须30个工作日。
【法律依据】
《中国公民因私事往来香港地区或者澳门地区的暂行管理办法》第二十四条
内地公民在前往香港、澳门之前遗失前往港澳通行证、往来港澳通行证的，应立即报告原发证机关，并由本人登报声明，经调查属实的，重新发给证件。
【温馨提示】
以上回答，仅为当前信息结合本人对法律的理解做出，请您谨慎进行参考！
如果您对该问题仍有疑问，建议您整理相关信息，同专业人士进行详细沟通。
在网上可以办港澳通行证？可以。以深圳为例，办理步骤如下：
1、首先，打开手机微信应用，在微信客户端中，搜索“深圳公安”，选择关注“深圳公安”微信公众号。
2、进入微信公众号平台页面之后，点击页面底部“民生”菜单选项，即可进入业务办理页面，在业务办理页面中先登录个人账号。
3、如果是首次办理港澳通行证的话，需要点击“出入境办证预约”按钮，根据自己的户口所在地来选择办理。
4、先选择办理通行证的地点、预约日期，选择完预约日期后，点击“下一步”，并同意申请协议书。
5、按照页面中的要求填写个人真实信息，然后选择“港澳通行证”，点击“确认提交”按钮之后，即可在指定时间、指定地点办理港澳通行证了。
6、如果是续签的话，则办理流程相对简单，点击“港澳个人游签注申请”选项，进入办理页面。
7、在办理页面中，选择个人需要进行注册的有效期限，填写完个人信息之后，点击“申请”按钮即可。
如何手机网上办理港澳通行证
网上办理港澳通行证方法
1、首先打开所属市的公安局出入境便民网。
2、打开公安局出入境便民网页面后，找到办证业务中的个人业务，在个人业务下面根据自己的实际情况选择广东省户籍或非广东省户籍，若你是非广东省户籍请点击非广东省户籍，点击后网页跳转到非广东省户籍的个人业务办理页面。
3、在非广东省户籍的个人业务办理页面中根据自己的实际情况选择，现以已有通行证，申请往来港澳个人旅游签注为例，点击已有通行证，申请往来港澳个人旅游签注，点击后页面跳转到已有通行证，申请往来港澳个人旅游签注页面。
4、在已有通行证，申请往来港澳个人旅游签注页面把如图所示的第1项，第2项，第3项全部选中，然后点击下一步。
5、进入申请协议书页面，阅读申请协议书后选择接受。
6、根据自己的实际情况，把自己的个人信息填完后，在是否邮寄一栏选择是，并填好自己的收件地址和联系方式，邮编，最后签名，选择下一步。
7、会弹出确认页面，如果确认自己填的信息准确无误就确认提交，提交后就坐等快递来取你的港澳通行证。
有效期限
证件有效期
往来港澳通行证有效期5年。2014年9月15日，全面启用电子往来港澳通行证规定，成年人电子往来港澳通行证有效期延长为10年，对未满16周岁的仍签发5年有效通行证。
签注有效期
内地居民往来港澳签注分为6个种类，即个人旅游(G)、探亲(T)、商务(S)、团队旅游(L)、其他(Q)、逗留(D)根据申请事由分类签发。其中香港G签和L签的有效期都为：3个月1次、3个月2次、1年1次、1年2次四种有效签注。澳门签注只有3个月1次、1年1次申请。签注规定每次在香港或者澳门逗留不超过7天，一进一出算一次。
签注有效期的解释
以1年1次为例，不是表示1年内只能去1次，而是指该签注的有效期为1年，在1年以内往返过港澳后，还可以再次申请签注，申请次数没有限制。如果1年内不去，则该签注过期无效，可再次申请。
